Fakultas Kedokteran Muhammadiyah memiliki misi yang jelas, yaitu berkontribusi sebagai kampus kedokteran unggul di Negara ini. Guna mencapai tujuan tersebut, berbagai upaya gigih dilakukan, termasuk peningkatan standar pelatihan, kajian terdepan, dan pelayanan kepada masyarakat luas. Selain hal, Jurusan juga berfokus peningkatan etik calon dokter,